羅馬諾夫王朝的皇室秘寶「回憶之卵」，意外地在日本發現了！就在鈴木財團展出的同時，柯南最強的對手——「怪盜基德」寄出「犯案預告信」，公然宣布將在眾目睽睽之下奪取這無價的皇家藝術之寶。柯南、小五郎、平次、灰原哀、小蘭一行人，受邀解讀預告信線索，不料發生致命的錯誤！基德成功偷走回憶之卵之後，途中卻遭神秘殺手狙擊，墜海失蹤。柯南以新型滑板追蹤，驚險奪回的「回憶之卵」，卻與原稿的設計完全不同，這究竟是怎麼回事？怪盜基德生死不明、服部平次身受重傷、彩蛋之謎尚未解開、神秘殺手再度行兇、小蘭也對柯南(工藤新一)的身份起了疑問……名偵探-江戶川柯南，終於遇上他一生中最大的危機，同時也是史上最難解的謎團！